C'est un grand jour pour Nanako (Émilie) car elle rentre au lycée Seiran (l'école des Fontaines en VF), une école de filles très chic et renommée. Elle fait la connaissance de Kaoru no Kimi (Danièle), Fukiko Ichinomiya / mademoiselle Miya (Clarisse) et Saint-Just, toutes des filles exceptionnelles. Comme à chaque rentrée, le Cercle de la rose, un étrange club qui rassemble l'élite de l'école, procède à une élection qui accueillera 10 nouvelles filles. Une année difficile commence pour Nanako.