Durante la Segunda Guerra Mundial, apareció un nuevo y extraño extraterrestre, el Genjuu (幻獣), cuyo único propósito es matar a la humanidad. Cada vez que aparecen, los Genjuu desprenden un olor extraño que es ácido para un humano y mata a muchos de los guerreros enviados a luchar contra él. Avanzamos 50 años. Hayami Atsushi es piloto del 5121. La cantidad de adultos muertos en la guerra ha obligado al gobierno a formar la Fuerza de Defensa de la Escuela Secundaria, donde niños de cierta edad y habilidades son criados en dormitorios para luchar contra los extraterrestres. Utilizan nuevos mechas (HWT) y trajes especiales antialienígenas fabricados por el grupo Shibamura. Un día reciben un nuevo estudiante transferido. Un excelente piloto de mechas que parece estar hecho de hielo y es un profesional matando al Genjuu. Ella se presenta como Shibamura Mai.